La historia de Silentium se remonta a diciembre de 1995 en las cenizas la banda de death/gothic metal llamada Funeral. De los restos de Funeral, el tecladista Sami Boman y el vocalista Matti Aikio crearon Silentium añadiendo al violinista Jani Laaksonen, guitarristas Toni Lahtinen y Juha Lehtioksa y el baterista Jari Ojala en la alineación.

La primera grabación de Silentium fue el demo Illacrimó que fue lanzado a finales de 1996. Su segundo trabajo, el Ep Caméne Misera fue lanzado en 1998 con la contribución de la vocalista Tiina Lehvonen que luego se convirtió en un miembro permanente de la banda. Después de algunas negociaciones Silentium firmo un acuerdo con Spikefarm y su primer álbum Infinita Plango Vulnera salio en 1999. El disco también presenta al nuevo baterista, Janne Ojala.

Infinita Plango Vulnera obtuvo muy buenos comentarios, agradando en todo el mundo, al igual que sus sucesores, el álbum del 2001 Altum y su hermana pequeña, el mini CD SI.VM...