Hijo del reconocido guitarrista de jazz Walter Malosetti, Javier se destaca como bajista, a pesar de su habilidad y estudio en batería, guitarra, canto, piano y otros instrumentos. Durante su carrera participó como integrante del grupo de Luis Alberto Spinetta, con quien grabó discos como: Pelusón of Milk, Don Lucero y Exactas. También tocó con muchos grandes artistas entre los que se destacan Dino Saluzzi, Lito Vitale, Jaime Ross, Alfredo Casero y Baby López Furst.

En 1987 comenzó a dar clases de bajo.

A principios de 1993 decidió grabar su primer disco solista llamado Javier Malosetti, el cual recibió muy buenas críticas de la prensa. Después de varias giras con distintos artistas, recibe el premio Clarín "Revelación en jazz del año" en el 2000.

Durante el 2001 salió a la venta su segundo disco, Spaghetti Boggie, que grabó con un quinteto conformado por Guillermo Romero en teclados, Ricardo Cavalli en Saxos, Américo Bellotto en trompeta, y Fernando Martínez en...